Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXC1Q12948 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms