Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC173Q0VFZ6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms