Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms