Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CXCL6P80162 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms