Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-21P61565 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms