Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP107P57740 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms