Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms