Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRHRP34981 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms