Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms