Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNA2P20248 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms