Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC9A1P19634 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms