Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2A2P16615 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2A2P16615 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms