Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNT1P13805 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms