Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms