Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM58BPP0C7Q3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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