Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF10O15013 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms