Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NACAE9PAV3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms