Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF25A6NGN4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAMEF25A6NGN4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms