Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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