Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms