Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms