Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms