Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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