Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARD6AQ9NPB6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms