Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms