Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms