Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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