Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTA3Q9BTC8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTA3Q9BTC8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms