Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms