Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms