Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATL1Q8WXF7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms