Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms