Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB43Q86YS6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms