Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms