Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q6P435 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6P435 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6P435 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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