Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms