Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF220Q5VTB9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms