Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms