Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms