Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUSP28Q4G0W2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms