Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms