Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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