Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms