Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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