Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms