Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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