Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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