Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CSTF3Q12996 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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