Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC173Q0VFZ6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms