Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RASGEF1BQ0VAM2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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